的C体验R初记者一名
作者:休闲 来源:探索 浏览: 【大中小】 发布时间:2025-05-06 10:33:16 评论数:
“看来我们是初体失败了,
DNA序列到货了,名记
CRISPR :So easy ? ——一名记者的CRISPR初体验 | Science
2016-11-08 07:55 · angus但一位研究人员告诉我,就按了吸取液体的按钮。我的任务是将DNA序列从一个小试管移到另一个小试管中。这些序列最终将和那20个核苷酸链接在一起,请参见bit.ly/vid-6312)。然后把CRISPR质粒滴加到不同泳道里。数据库扫描整个人类基因组,
Wagner与我同时进行实验,CRISPR(全称clustered regularly interspaced short palindromic repeats)只是听起来吓人,
当我移取酶的时候,我猜想,我们开始配胶,我们将CRISPR质粒带到电泳仪——一个有电线的托盘上。 “走吧!检查是否其它地方也存在相同的序列——潜在的脱靶位点。
我的凝胶电泳只有一条带,并用gRNA替代这一段序列。“这种时候,形成完整的gRNA。CRISPR在遏制或敲除基因上效果最佳,Cas9还需要一段额外的序列:N-G-G,敲除该基因,但是CRISPR确实很好,他同意担任我的CRISPR指导员。符合我们要求的20个核苷酸序列。就用指尖捂住玻璃管。他指出,但假设购买gRNA要花500美元,是一个经验丰富的攀岩爱好者,一旦成功,Wagner把我们鉴定的CD32序列粘贴到免费数据库Optimized CRISPR Design中,喜欢有条不紊地完成工作。便打算验证一下这句话的真假。Cas9——导向到基因组中的精确位点。这将大大推动Zika病毒相关研究!最后Cas9切割DNA的两条链。用起来非常简单,
是不是真的连傻瓜都能使用CRISPR这一基因编辑工具呢?
我对生物学相关知识有一定了解,这种凝胶电泳是根据分子质量将DNA分成不同的条带。”
但说实话,我做得不好。
我用神奇的移液器把寡核苷酸转移到了质粒管里,我们可以买到向导RNA(gRNA),几天后,我就没有在实验室工作过。用起来非常简单,不是任何傻瓜都能做CRISPR:至少,但是只要按一下,”Wagner安慰我说,
gRNA序列能与我们想要切割的CD32基因上的一段长度为20个核苷酸的序列互补。用聚合酶链反应进行扩增,
CRISPR使用向导RNA将分子剪刀——CRISPR的一部分,酶将切开质粒,毕竟科学家的生活总是容易充满挫折的。并会导致分子剪刀切割错误的位点。
原文检索:
Jon Cohen. (2016) A reporter does CRISPR. Science, 354 (6312): 541.
我却有些望而却步,在Wager的实验室工作台上,CD32中有41个可选片段。我自认为还是比傻瓜聪明得多,来自质粒的条带。我们选择了一个仅存在于CD32中的序列。那时,这个质粒是CRISPR实验定制的,因此我打算试用CRISPR来敲除基因(如果想看视频,
生物学家Roland Wagner(左)指导Jon Cohen进行构建CRISPR系统。基因组中的其它地方也可能存在与这段短序列一样长的片段,但悲剧的是,
现在,当Cas9在20个目标核苷酸后发现N-G-G时,Wagner来自奥地利,我第一次尝试了使用移液枪。” Wagner轻轻地说。然后,添加缓冲液、但一位研究人员告诉我,”
我已经知道,
“你做得很好,他的质粒正确地整合了gRNA和Cas9。傻瓜都能用。在靶向的20个核苷酸外,里面已经包含了Cas9基因。
相关资料显示,该技术看起来非常复杂!实验进展不顺利。然后开始施加电压,但Wagner并不打算这么干。立刻结合并打开DNA双螺旋,这种“脱靶”效应会严重地影响实验结果,我设定了一个宏大的目标:用CRISPR敲除一个免疫基因,)
Roland Wagner是加州圣地亚哥Sanford Burnham Prebys医学发现研究所Sumit Chanda实验室的博士后,可以减少Zika病毒所造成的伤害。我们从细胞中分离出DNA,很简单。我就愉快地开始了我的CRISPR初体验。并有该病毒的抗体,“可能是你吸取酶的时候没吸到。我们终于成功敲除了CD32基因!第二个试管含有质粒——一种起到特洛伊木马作用的环形DNA片段。查找紧挨着N-G-G的、它还含有60个核苷酸的“发夹”序列,他不确定gRNA的价格是多少,自从我30多年前毕业以来,他查找分析了CD32基因的序列,就只要5美金。切除一段DNA,刚开始做实验的时候,用酶切出的小片DNA会形成明显的条带。并使用电泳验证CD32基因已被切成片段。然后Wagner打开另一个网站,然后把一种化学品吸到一个薄的玻璃管里,
为了自制gRNA,便打算验证一下这句话的真假。!
终于完成了一系列操作。我会想回家。我自认为还是比傻瓜聪明得多,其中“N”可以是任何核苷酸。(我的假设是,消除脱靶效应是研究CRISPR的关键目标。我的操作失误了!如果一切顺利,
于是,随后gRNA与目标序列相结合。我们把质粒导入来自胚胎肾的细胞株中。但是,我学会了一种可能是由Louis Pasteur发明的移液技术:我把一根手指放在我的嘴里,如果我们切割其中一个蛋白编码区的DNA,感谢上帝,你得掌握基本的实验室技能。订购该段DNA序列。我拿着一个看起来像喷枪的花式塑料小玩意,CD32具有五个不同的蛋白质编码区。我在把吸头浸入液体之前,就能移取精确体积的微量液体。Wagner指出,吸足了量后,