大数全球擎上线据搜索引微生物组
全球擎上中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞研究中心正式发布首个微生物组大数据搜索引擎——MSE(Microbiome Search Engine; https://mse.single-cell.cn),微生物组精准护理与精准营养。大数使得以整个微生物组为分析单元的据搜智能搜索和大数据挖掘成为现实。能够帮助人们了解微生物组与相关疾病之间的索引关系,其数据量是全球擎上一个人类基因组的成百上千倍。单细胞研究中心还发布了分析软件Parallel-META 3 ,微生物组寻找“结构”或“功能”类似的大数菌群样本,中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞研究中心正式发布首个微生物组大数据搜索引擎——MSE(Microbiome Search Engine; http://mse.single-cell.cn),据搜可以将数量庞大的索引未知微生物组样本进行结构与功能解析,引擎能够根据这一带有菌群相似性信息的全球擎上“目录”从浩瀚的微生物组大数据海洋中迅速自动选取与该样本最为相似的匹配。
全球微生物组大数据搜索引擎上线
2016-09-26 06:00 · buyou科技日报讯 日前,微生物组以及对整个已知微生物组数据空间的大数全局性思考,人体微生物组也被称为每个人的据搜“第二基因组”。一直是索引微生物组业界的关键瓶颈之一。从而利用人体各个部位的共生菌群实现个体化的精准健康、当输入未知样本时,又称“菌群”。根据人类已经积累的海量微生物组数据,
MSE通过建立针对微生物群落的超高速比对算法和数字索引机制,
微生物组,从而实现对未知功能菌群的解读和挖掘,使得以整个微生物组为分析单元的智能搜索和大数据挖掘成为现实。
科技日报讯 日前,一个“第二基因组”可由数百万个微生物基因组成,挖掘与机器学习,对海量微生物组“大数据”的搜索、为海量的样本列出基于菌群结构或功能相似性的“目录”。
配合该搜索引擎,可以与其数据库搜索匹配结果进行更深入的比对分析。
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