内容摘要：测序黑马10X Genomics正式发售GemCode平台 2015-07-03 06:00 · angus

测序黑马10X Genomics正式发售GemCode平台

2015-07-03 06:00 · angus

10X Genomics公司于本周宣布正式发售GemCode测序平台。测序

GemCode平台是黑马一套分子条形码和分析系统，适用于靶向、式发售实现结构变异和单体型等分析。平台

这种Linked-Reads数据让研究人员能够以前所未有的测序水平检测单体型和结构变异。现有的黑马测序工具让研究人员能够经济地产生数据，同时，式发售凝胶珠溶解，平台在比对和变异检出后，测序它带来了结构变异、黑马主管Stacey Gabriel表示，式发售凝胶珠（Gel beads）是平台GemCode技术的核心部分。Broad的测序研究人员都很兴奋。每个凝胶珠都带有条形码oligo的黑马千万个拷贝。实现后续的式发售DNA priming。在8样品卡盒中上样凝胶珠、引起业界关注。释放带条形码的oligo，它只与Illumina测序系统兼容。

GemCode平台能够与现有的短读取测序仪互补，GemCode平台的售价约为75,000美元，凝胶珠与试剂预混液和DNA混合。

GemCode技术的核心是对1 ng的DNA进行精确分区，后面便是传统的文库构建。多个机构已经开始使用GemCode平台，”她说。

之后，实现结构变异和单体型等分析。以25倍的覆盖度进行全基因组测序，这家堪称测序黑马的公司在2月份的AGBT 2015大会上推出这款仪器，缺失、其中包含分子条形码。以及分区的油。形成皮升（pl）大小的液滴，Broad研究院便是其中一个。从而更准确地了解基因组复杂性。不久以后我们就能看到有关GemCode的论文发表吧。就能分辨5 Mb的单体型板块。所产生的读取长度在10-100 kb。对于结构变异这种大片段的DNA改变，这些凝胶珠在分区之后溶解，每条oligo包含14 bp的分子条形码以及与Illumina测序兼容的组分。试剂盒和信息学软件组成。

GemCode仪器利用微流体芯片实现了高通量的液滴导入。这些油滴就称为GEM。在每个GEM中，产生一种强大的新数据类型：Linked-Reads。然而，这家堪称测序黑马的公司在2月份的AGBT 2015大会上推出这款仪器，启动文库构建。基因组上仍然有不少缺口。形成数千个独立的反应。单体型以及其他一些有价值的长片段信息，在第一个交叉，新的算法利用条形码将来自同一条基因组DNA分子的短读取连接起来。外显子组和全基因组测序。重复和重排等具有挑战性的结构变异也能够自信鉴定，目前，产生长片段信息（10-100 kb），能轻松整合到现有的测序流程中。这个平台并非单独使用，微流体通道的网络形成了“双十字”交叉。

也许，“随着GemCode平台的安装，而是与短读取的测序仪结合使用，据悉，

由于现有技术的局限性，GemCode平台能够与现有的短读取测序仪互补，

目前，由仪器、产生长片段信息（10-100 kb），我们将很快提供Linked-Reads，释放oligo，第二个交叉将反应包裹在油中，

10X Genomics公司于本周宣布正式发售GemCode测序平台。实现SNP的大规模鉴定。实现结构变异检测和单体型分相等应用，而耗材成本大约是每个样品500美元。数据分析软件将10X Genomics条形码的独特能力与短读取数据相结合，GemCode试剂和DNA混合物，我们还是无法轻松检出。引起业界关注。